¿Puedo denunciar a un colegio en la Superintendencia y poner un Rec. de Protec.?

Una persona, diagnosticado con autismo es excluido de asignaturas del colegio y se toman medidas injustas en su contra, es hostigado y discriminado por los mismos funcionarios del colegio en diferentes ocasiones (comprobables). Últimamente, lo denunciaron de una causa muy grave en Fiscalia, dañándolo psicológicamente. ¿Que es lo que puedo hacer? ¿Se puede hacer la denuncia en la Superintendencia de Educación y ,a la vez, poner un Recurso de Protección en la Corte de Apelaciones?. Gracias